ClustalW: A lógica matemática dos algoritmos de alinhamento múltiplo

Se você começou na bioinformática há alguns anos, provavelmente sua primeira interação com alinhamento múltiplo foi no BioEdit ou no site do EBI, selecionando o clássico ClustalW. A gente carregava o FASTA, clicava em “Run” e esperava a mágica acontecer. Mas o que a “caixa preta” do software está realmente fazendo? E por que, em…