Uma problema que tive logo que comecei a trabalhar com biologia molecular e que recentemente em conversa com uma aluna de mestrado, me voltou a memória, é a concentração de DNA que o nanodrop te dá. No começo me lembro que só de ver uma número alto, por exemplo 900 ng/ml, eu ficava super contente,…
Categoria: molecular biology
ClustalW: A lógica matemática dos algoritmos de alinhamento múltiplo
Se você começou na bioinformática há alguns anos, provavelmente sua primeira interação com alinhamento múltiplo foi no BioEdit ou no site do EBI, selecionando o clássico ClustalW. A gente carregava o FASTA, clicava em “Run” e esperava a mágica acontecer. Mas o que a “caixa preta” do software está realmente fazendo? E por que, em…
Desenho de primers
Processo pré-desenho de primers Antes de iniciar o desenho de primers é necessário verificar algumas informações básicas, como: Tamanho em pares de base do gene alvo Região codificante do gene alvo (CDS) Quantidade de sequências depositadas em banco de dados (ex. GenBank) e tamanho das mesmas, verificar sequências que são predicted. NOTA: Para maiores informações…
Data Science 